翻譯/ 水產(chǎn)前沿雜志 孫旭東 據(jù)Shrimp News 9月23日消息，最近，一種引起對(duì)蝦急性肝胰腺壞死癥（AHPND）的菌株——弧菌（KC13.17.5）在越南北部地區(qū)的蝦中被分離出來。一般認(rèn)為，AHPND通常是由副溶血弧菌引起的，但是通過對(duì)這種被分離出來菌株的基因組測(cè)序，表明它屬于哈氏弧菌。該測(cè)序數(shù)據(jù)主要包括質(zhì)粒序列和假定特征基因序列。  圖片來源于網(wǎng)絡(luò) 在越南乃至全亞洲，對(duì)蝦養(yǎng)殖都具有很大的經(jīng)濟(jì)價(jià)值且發(fā)展態(tài)勢(shì)良好。直到2011年，由于早期死亡綜合征（EMS，科研上稱為對(duì)蝦急性肝胰腺壞死癥AHPND）的大規(guī)模爆發(fā)，對(duì)對(duì)蝦產(chǎn)業(yè)造成巨大影響，對(duì)蝦產(chǎn)量也開始急劇下滑。在部分地區(qū)AHPND的致死率甚至達(dá)到100%，整口蝦塘完全絕收。而后有專家通過PCR（聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)）技術(shù)鑒定出，引起AHPND的致病菌是副溶血弧菌。并且最早被發(fā)現(xiàn)攜帶致病基因的菌株據(jù)推測(cè)來自泰國和墨西哥。 當(dāng)時(shí)有專家指出，由于AHPND的致病性基因片段被嵌合在質(zhì)粒上，那么有致病能力的質(zhì)粒很可能不僅僅只在副溶血弧菌之間傳播，而是在其他種類細(xì)菌中也有可能存在。不過在很長一段時(shí)間內(nèi)此說法沒有得到廣泛證實(shí)。 此次在越南被發(fā)現(xiàn)的AHPND致病菌株，被分離鑒定后證明其屬于弧菌屬，但是其基因序列的某一片段卻表明它并不是副溶血弧菌這個(gè)種類。為了進(jìn)一步研究這株弧菌的基因?qū)W特征，其遺傳物質(zhì)被進(jìn)一步測(cè)序。 專家稱，測(cè)序方法有以下幾個(gè)步驟：第一，通過DNA樣品制備試劑盒制備基于目的基因的基因文庫；第二，通過實(shí)驗(yàn)室儀器對(duì)該文庫進(jìn)行測(cè)序；第三，對(duì)測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行組裝并分析；第四，將分析結(jié)果與已知的質(zhì)粒基因和致病性特征基因作比對(duì)從而找出同源序列。 結(jié)果顯示該菌株的基因組有42個(gè)Scaffolds（拼接，分子生物學(xué)概念），5288個(gè)有效編碼基因。最終的特征鑒定表明與其最接近的菌株是哈氏弧菌（Vibrio harveyi）。同時(shí)，使用預(yù)測(cè)基因的同源性搜索證明，同副溶血弧菌相比該菌株與哈氏弧菌有更高的相似度。測(cè)序結(jié)果也表示，致病基因位于該菌株的質(zhì)粒上，通過PCR技術(shù)也證明了其可以導(dǎo)致AHPND。 此外，實(shí)驗(yàn)室進(jìn)一步對(duì)該菌株基因組42個(gè)Scaffolds的研究，得出該菌株可能是通過獲取帶有致病基因的質(zhì)粒而產(chǎn)生致病性。對(duì)這一說法，相關(guān)人士分析，早前副溶血弧菌在對(duì)蝦養(yǎng)殖過程中大規(guī)模爆發(fā)時(shí)研究人員作出的推論或被證實(shí)。 雖然該報(bào)道指出該菌株“最接近”哈氏弧菌，但其細(xì)胞內(nèi)攜帶有導(dǎo)致AHPND的相關(guān)質(zhì)粒和致病性特征基因是肯定的。首先發(fā)現(xiàn)該菌株的實(shí)驗(yàn)室稱，該菌株的基因組序列僅僅是與哈氏弧菌序列最為相似，并不等于攜帶著嵌合有致病基因的質(zhì)粒不可能被傳送到其他種不同的弧菌中。那么本次發(fā)現(xiàn)到底是個(gè)案還是具有廣泛意義，以及為何基因能夠跨種類傳播？該實(shí)驗(yàn)室表示，目前相關(guān)深入研究正在開展當(dāng)中，最新結(jié)果將及時(shí)公布從而可以讓廣大水產(chǎn)養(yǎng)殖人士更好的應(yīng)對(duì)AHPND，防止進(jìn)一步傳播。 【關(guān)鍵字】：對(duì)蝦，AHPND，EMS，副溶血弧菌，哈氏弧菌，水產(chǎn)養(yǎng)殖網(wǎng) |
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